Princip MBBR procesa je povećanje biomase i vrsta u reaktoru dodavanjem određene količine nosača suspenzije u reaktor, kako bi se poboljšala efikasnost tretmana reaktora. Budući da je gustina punila bliska onoj u vodi, tokom aeracije se potpuno miješa sa vodom, a okruženje za rast mikroba je plin, tekući i čvrsti. Efekat sudara i smicanja nosača u vodi čini mjehuriće zraka finijim i povećava stopu iskorištenja kisika. Osim toga, svaki nosač ima različite biološke vrste iznutra i izvana, iznutra rastu neke anaerobne bakterije ili fakultativne bakterije, a izvana su dobre trofičke bakterije, tako da je svaki nosač minijaturni reaktor, tako da reakcija nitrifikacije i reakcija denitrifikacije postoje istovremeno vremena, kako bi se poboljšao učinak tretmana.
